醫(yī)院特殊科室凈化工程是一項復雜且高度專業(yè)化的工程，涉及到空氣質量控制、溫濕度控制、微生物控制等多個方面。為了確保工程質量和安全，承接此類工程的公司通常需要具備以下資質：

建筑業(yè)企業(yè)資質：

建筑機電安裝工程專業(yè)承包資質：這是進行機電設備安裝工程的基本資質。

建筑裝修裝飾工程專業(yè)承包資質：涉及到室內裝修和裝飾工程。

醫(yī)療器械生產或經營許可證：

如果工程涉及到醫(yī)療器械的安裝和調試，可能需要具備相關的許可證。

潔凈室工程專業(yè)資質：

潔凈室工程設計與施工資質：專門針對潔凈室設計和施工的資質，確保公司有能力進行高標準的潔凈室工程。

ISO認證：

ISO 9001質量管理體系認證：確保公司在質量管理方面達到國際標準。

ISO 14001環(huán)境管理體系認證：確保公司在環(huán)境管理方面達到國際標準。

ISO 45001職業(yè)健康安全管理體系認證：確保公司在職業(yè)健康和安全管理方面達到國際標準。

安全生產許可證：

確保公司在施工過程中能夠遵守安全生產的相關法律法規(guī)。

工程設計資質：

建筑工程設計資質：如果公司負責設計部分，需要具備相應的設計資質。

專業(yè)技術人員資質：

項目經理、設計師、工程師等關鍵崗位的人員需要具備相應的職業(yè)資格證書，如注冊建造師、注冊工程師等。

其他相關資質：

消防設施工程專業(yè)承包資質：如果工程涉及到消防設施的安裝和調試。

電子與智能化工程專業(yè)承包資質：如果工程涉及到智能化系統(tǒng)的安裝和調試。

行業(yè)認證和會員資格：

例如，中國潔凈技術協(xié)會（CCAA）等行業(yè)組織的會員資格或認證。

地方性要求：

不同地區(qū)可能有特定的地方性法規(guī)和要求，需要根據(jù)項目所在地的具體情況進行準備。

在實際操作中，具體需要哪些資質可能會根據(jù)項目的具體要求和當?shù)氐姆ㄒ?guī)有所不同。因此，在承接醫(yī)院特殊科室凈化工程之前，建議詳細了解項目要求和當?shù)胤ㄒ?guī)，并確保公司具備所有必要的資質和認證。